Wasza parafia należy do 150 parafii erygowanych przez kard. Macharskiego, który bardzo się starał, by tam, gdzie jest potrzeba, powstawały parafia i kościół – stwierdził w kazaniu bp Roman Pindel. Przypomniał, że stało się to w roku 1991, gdy Malec administracyjnie przynależał do archidiecezji krakowskiej. Podkreślił jednocześnie, że istnienie parafii należy utożsamiać z łącznością z diecezją i biskupem oraz z Kościołem powszechnym i Ojcem Świętym. – Pokropienie wodą, namaszczenie ma oznaczać, że Bóg jest Panem i bierze w swoją opiekę, we władanie tę wybudowaną i konsekrowaną świątynię – tłumaczył hierarcha. Jednocześnie podkreślił, że wiara to naturalna symbioza parafian z murami wzniesionego przez nich kościoła. – Kościół powstaje z wiary, z pragnienia jej wyrażenia na zewnątrz, posiadania godnych warunków do słuchania słowa Bożego i do udzielania sakramentów – dodał Ordynariusz. Po kazaniu bp R. Pindel umieścił w stole eucharystycznym relikwie bł. o. Michała Tomaszka i bł. Zbigniewa Strzałkowskiego. W dalszej kolejności okadził go i namaścił olejem. Dokument stwierdzający uroczyste poświęcenie kościoła odczytał dziekan dekanatu kęckiego, ks. Jerzy Musiałek. Znalazły się w nim wskazania dotyczące odpustu parafialnego, który przewidywany jest na 20 października lub na sąsiadującą z tą datą niedzielę. Na uroczystości obecni był artysta Wacław Sobieraj, którego dziełem są obrazy zdobiące wnętrze świątyni: św. Faustyny Kowalskiej, bł. ks. Michała Sopoćki i bł. ks. Jerzego Popiełuszki. – Wierzymy, że ten wyjątkowy moment zapisze się w historii naszej społeczności jako wyraz naszej wiary i jedności oraz rozpocznie nowy rozdział w naszym chrześcijańskim życiu – mówiła w imieniu parafian Julia Baścik. – Jeżeli człowiek swoje pragnienia i dążenia ulokuje w zgodności z wolą Bożą, to Pan Bóg je zaspokoi. Trzeba tylko cierpliwości. Przedstawiciel parafii wspomniał, że ta cierpliwość w oczekiwaniu na własny kościół to ponad sto lat. I jest skutek – mówił proboszcz ks. Marian Mazurek.

Pierwszym miejscem modlitwy dla społeczności w Malcu była mała kapliczka wzniesiona w latach 1848-49. Za sprawą ks. F. Zadęckiego, proboszcza z Osieka, w 1892 r. zainaugurowano w niej sprawowanie Mszy św., co uświetniono wystrzałem z moździerza. Impuls do wybudowania kościoła wyszedł po wizytacji duszpasterskiej z 1956 r. biskupa krakowskiego Franciszka Jopa. Poczynione przez ks. Władysława Groksa starania rozbiły się wtedy o mur komunistycznej biurokracji. Jedyne, co osiągnięto, to rozbudowa kapliczki. Temat wrócił, i to z sukcesem, w latach 80. Prace przy wzniesieniu świątyni rozpoczęto w 1983 r., a rok później kard. Franciszek Macharski wmurował kamień węgielny poświęcony przez Jana Pawła II podczas jego drugiej pielgrzymki do Ojczyzny. Budowę pilotował ks. Zdzisław Budek, który w roku 1991 został pierwszym proboszczem parafii w Malcu. Po nim urząd ten pełnili: ks. Jacek Jaskiernia, ks. Jan Gawlas, ks. Waldemar Niemiec, a od 2015 r. ks. Marian Mazurek. Przed Wielkim Jubileuszem Roku 2000 dzięki życzliwości ks. Władysława Gasidły, kustosza Grobu św. Jana Kantego w Krakowie, do kościoła w Malcu trafiły relikwie patrona parafii. Historię wznoszenia świątyni i sąsiadującej z nią kapliczki przedstawił podczas uroczystej konsekracji Bolesław Paw.